Construit par le facteur alle­mand E.F. Walcker, il fut inau­guré lors de la consécration de l'église, le 09 ma i 1897. Mais le nom d'Emile Rupp (1872-1948), pre­mier titulaire, doit également être lié à l'instrument de manière indissociable. En effet, porte-dra­ peau, avec A. Schweitzer, du mou­vement de la "Réforme alsacienne de l'orgue", E. Rupp entreprit de transformer profondément l'esthétique de l'orgue primitif, inspiré qu'il était par les instruments de Cavaillé-Coll et la facture ancien­ne. En 1934, d'importants travaux, effectués par les successeurs de Cavaillé-Coll ( Beuchet), couronnè­rent sa réflexion et son action. L'harmoniste Hurbain travailla neuf mois à la réharmonisation de l'orgue !

C' est aujourd'hui encore ce même instrument : l'un des plus grands d'Alsace, avec ses 74 jeux et son es­ thétique symphonique résolument française, la facture de Walcker n'ayant toutefois pas été totalement gommée. En 1948, Paul Nardin, élève de P. Segong et d'A. Marchal, succède à E. Rupp. Il préconise, en 1958-59, une restauration de l'or­gue, élaborant avec Alfred Kern une composition néo-classique. Faute de moyens, les travaux ne furent ja­mais réalisés ; 21 jeux, qu'il était prévu de modifier ou de remplacer, furent toutefois débranchés et la console transformée.

Le 26 juin 1985, à la demande de la paroisse, l'orgue est classé Monument Historique par la Com­mission Supérieure des Monuments Historiques, section Orgues. L'instrument laissé par E. Rupp sera donc conservé et restitué.

Construit par M. Garnier en 1976, il est d'une esthétique complé­mentaire de celle du Grand-Orgue, proche de la facture des orgues de l'Allemagne du Nord à la fin du XVII ème siècle (octave courte, sommier à ressorts, tempérament me­satanique...). Il a été conçu spécia­lement pour accompagner les cho­rals et les psaumes et interpréter la musique antique des XVI ème et XVII ème siècles.

Durant ses 42 années de ministère, E. Rupp a donné environ 1 400 concerts dominicaux ! La paroisse et l'Association des Amis du Grand­ Orgue continuent, au-delà de l'usa­ge cultuel, à mettre à la dispositon du public leur patrimoine instrumental, en particulier chaque mer­credi de Juillet par des récitals qui veulent faire découvrir de jeunes talents.